El paisatge del Pla de l'Estany, com el mateix nom de la comarca, gira entorn de la presència de l'estany, com a punt central. Aquest fet el fa en recrea la diversitat de la fauna (d'ocells, especialment al voltant de l'estany, on anualment hivernen més de cent espècies diferents: bernats pescaires, ànecs de coll verd, diversos tipus de gavians, aus rapinyaires...), i flora. La seva singularitat està clarament lligada a l'aigua: el sistema lacustre, format per un conjunt d'estanyols i presidit per l'estany de Banyoles, n'és el tret d'identitat. Cal ditar el Clot d'Espolla, un dels estanyols intermitents, on hi trobem una espècie de el triops crancriformis, un crustaci primitiu molt singular. Al Pla de l'Estany hi trobem pins i alzines, així com salzes, verns, freixes i pollancres.
Des de l'administració, el Consorci de l'Estany - espai natural - és qui vetlla per la preservació i la revalorització del patrimoni natural i cultural, de cara a impulsar les funcions econòmiques mediambientals i socials pròpies de l'Espai d'Interès Natural de l'Estany de Banyoles.
Limnos - l'Associació de Defensa del Patrimoni Natural de Banyoles i comarca - recull de dades i organitza jornades dedicades a l'observació i estudi de la natura als espais naturals del Pla de l'Estany, especialment pel què fa a fauna i molt especialment a aus. Es publiquen en aquest lloc web.